Zweck dieser Übung ist das Erkennen von Sekundärstrukturelementen.

Jmol-Applet aktivieren. Sekundärstruktur Beispiel: - alpha Helix Frage: Wie viele Residuen braucht es für eine Windung (360°)?

Jmol-Applet aktivieren. Sekundärstruktur Beispiel: - beta Faltblatt Frage: Warum nennt man dieses Motif antiparalleles beta Faltblatt?

Jmol-Applet aktivieren. Sekundärstruktur Beispiel: - alpha Helix Die alpha-Helix ist eines der häufigsten Sekundärstrukturelementen in Proteinen. Wasserstoffbrücken zwischen den N und O Atomen des Rückgrades tragen zur Stabilisierung der Helix bei. Fragen: Gibt es Regelmässigkeiten im Muster der Wasserstoffbrücken? Welche elektrostatischen Eigenschaften weisst eine alpha-Helix auf?

Jmol-Applet aktivieren. Sekundärstruktur Beispiel: - beta Faltblatt Ein weiteres wichtiges Element der Sekundärstruktur in Proteinen ist das anti-parallele beta-Faltblatt. Wie bei der alpha-Helix, so bewirken auch hier Wasserstoffbrücken die Steifigkeit. Frage: Gibt es Regelmässigkeiten im Muster der Wasserstoffbrücken?

Jmol-Applet aktivieren. Sekundärstruktur Beispiel: - beta Faltblatt Frage: Warum bezeichnt man dieses Motif als paralleles beta-Faltblatt?

Jmol-Applet aktivieren. Sekundärstruktur Beispiel: - paralleles beta Faltblatt Auch hier sind wiederum die Wasserstoffbrücken zwischen den N und O Atomen des Rügrades für die Stabilitä:t verantwortlich. Fragen: Gibt es Regelmässigkeiten im Muster der Wasserstoffbrücken? Was sind die wichtigsten Unterschieden im Wasserstoffbrückenmuster zwischen parallelen und anti-parallen beta-Faltblattstrukturen?