Computational Chemistry SS 2019

Dozent:

PD Dr. Michael Hutter

Tutoren:

PD Dr. Michael Hutter, Lea Eckhart

Vorlesungszeit:

Montag, 10:15 Uhr – 11:45 Uhr, E2 1, Raum 007, Beginn: 15.04.19

Übungen:

Montag, 11:45 Uhr – 13:15 Uhr, E2 1, Raum 007. Beginn: 29.04.19

Klausur:

Montag, 08. Juli 2019, 10:15 Uhr, E2 1, Raum 007; verbindliche Anmeldung im LSF bis zum 01.07.2019 – unbedingt beachten!

Nachklausur:

Der Termin wird noch bekanntgegeben.

Voraussetzungen:

Grundkenntnisse der Vorlesung “Physikalische Chemie” hinsichtlich des Themengebiets Thermodynamik werden vorausgesetzt, sind aber nicht verbindlich erforderlich.

Inhalte:

Die Vorlesung richtet sich an Bioinformatik-Studierende im 4. oder 6. Semester des Bachelor-Studiums und an interessierte Studierende der Biotechnologie. Die Vorlesung enthält zwei Themenblöcke: (1) Kraftfeld-Verfahren und (2) eine Einführung in die Quantenchemie, wobei hier die Anwendung betont wird. Im ersten Teil werden empirische Kraftfelder vorgestellt, Verfahren zum Auffinden optimaler Molekülgeometrien (Energieminimierung und Durchsuche des Konformationsraums von Molekülen), zur Berechnung von Bindungsenergien, Docking-Simulationen und zur dynamischen Simulation von Gleichgewichtszuständen (Moleküldynamik). Im zweiten Teil werden Varianten der Quantenchemie wie die Hartree-Fock-Methode, die Dichtefunktionalmethode und semi-empirische Verfahren vorgestellt und Anwendungen zur Berechnung von Moleküleigenschaften und von Solvatationseigenschaften.

Voraussetzungen für den “Schein”:

Bestehen der Abschlussklausur.

Voraussetzungen für die Teilnahme an der Abschlussklausur:

Erreichen von insgesamt mindestens 50% der möglichen Punkte aus den wöchentlichen Übungsblättern.

Leistungspunkte/Credits:

6 (V2/Ü2), Bachelorstudiengang Bioinformatik

Language

This course is taught in German language.

Vorlesungen:

1. Vorlesung: 15.04.2019 Vorlesung 1  Übungsblatt 1
2. Vorlesung: 29.04.2019 Vorlesung 2 Übungsblatt 2
3. Vorlesung: 06.05.2019 Vorlesung 3 Übungsblatt 3
4. Vorlesung: 13.05.2019 Vorlesung 4 Übungsblatt 4
5. Vorlesung: 20.05.2019 Vorlesung 5 Übungsblatt 5
6. Vorlesung: 27.05.2019  Vorlesung 6 Übungsblatt 6
7. Vorlesung: 03.06.2019  Vorlesung 7  Übungsblatt 7
8. Vorlesung: 17.06.2019  Vorlesung 8  Übungsblatt 8
9. Vorlesung: 24.06.2019  Vorlesung 9 & 10  Übungsblatt 9
10. Vorlesung: 01.07.2019 Vorlesung 11   –
 08.07.2019 Klausur
15.07.2019  Klausurbesprechnung