Computational Chemistry SS 2022

Vorlesungszeit:

Montags, 10:15 Uhr – 11:45 Uhr, Gebäude E2 1, Raum 007; Beginn: 25.04.22

Übungen:

Montags, 11:45 Uhr – 13:15 Uhr,  Beginn: 25.04.2022, Gebäude E2 1, Raum 007

Klausur:

Die Klausur findet statt am Montag, d. 01. August 2022 von 10:00 Uhr bis 12:00 Uhr in E2 1, Raum 007. Eine Anmeldung im LSF bis zum 25.07.22 ist Voraussetzung für die Teilnahme.

Nachklausur:

Voraussichtlich am 26.10.2022 (erste Vorlesungswoche im Wintersemester), 16:15 Uhr.

Voraussetzungen:

Grundkenntnisse der Vorlesung “Physikalische Chemie” werden vorausgesetzt, sind aber nicht verbindlich erforderlich.

Inhalte:

Die Vorlesung richtet sich an Bioinformatik-Studenten im 4. oder 6. Semester des Bachelor-Studiums und an interessierte Chemie-Studenten. Die Vorlesung enthält zwei Themenblöcke: (1) Kraftfeld-Verfahren und (2) eine Einführung in die Quantenchemie, wobei die Anwendung betont wird. Im ersten Teil werden empirische Kraftfelder vorgestellt, Verfahren zum Auffinden optimaler Molekülgeometrien (Energieminimierung und Durchsuche des Konformationsraums von Molekülen), zur Berechnung von Bindungsenergien, zur dynamischen Simulation von Gleichgewichtszuständen (Moleküldynamik), sowie Docking-Simulationen. Im zweiten Teil werden Varianten der Quantenchemie wie die Hartree-Fock-Methode, die Dichtefunktionalmethode und semi-empirische Verfahren vorgestellt und Anwendungen zur Berechnung von Moleküleigenschaften und von Solvatationseigenschaften.

Voraussetzungen für den “Schein”:

Bestehen der Abschlussklausur

Voraussetzungen für die Teilnahme an der Abschlussklausur:

Keine

Leistungspunkte/Credits:

6 (V2/Ü2), Bachelorstudiengang Bioinformatik

Language

This course is taught in German language.

Videos zur Vorlesung

werden gegebenenfalls über MS-Teams bereitgestellt

Vorlesungen:

1. Vorlesung: 25.04.2022 PDF Übungsblatt 1
2. Vorlesung: 02.05.2022 PDF Übungsblatt 2
3. Vorlesung: 09.05.2022 PDF Übungsblatt 3
4. Vorlesung: 16.05.2022 PDF Übungsblatt 4
c7h16.pdb
5. Vorlesung: 23.05.2022 PDF Übungsblatt 5
6. Vorlesung: 30.05.2022 PDF Übungsblatt 6
7. Vorlesung: 13.06.2022 PDF Übungsblatt 7
8. Vorlesung: 20.06.2022 PDF Übungsblatt 8
9. Vorlesung: 27.06.2022 PDF Übungsblatt 9
10. Vorlesung: 04.07.2022 PDF
11. Vorlesung: 11.07.2022 PDF
12. Vorlesung: 18.07.202